ВГУВТ, являясь одним из старейших университетов Нижегородской области и одним из ведущих транспортных вузов России, имеет многолетнюю историю фундаментальных и прикладных исследований.

Университет имеет ряд признанных достижений в областях скоростного судостроения, гидротехнического строительства, управления транспортом, является пионером разработки судов катамаранного типа в СССР.

Организаторами и основателями ведущих научных школ являются такие признанные ученые, как Густав Васильевич Тринклер (доктор технических наук, изобретатель бескомпрессорного дизельного двигателя), Михаил Яковлевич Алферьев (доктор технических наук, основоположник строительства катамаранов в СССР), Михаил Иванович Волский (доктор технических и биологических наук, автор ряда фундаментальных работ в области физиологии дыхания).

Сегодня Волжский университет водного транспорта это динамично развивающийся вуз ведущий научную и инновационную работу на уровне мировых стандартов. Полувековой опыт по выполнению фундаментальных и прикладных научных исследований для ведущих предприятий отрасли и высокий профессионализм научно педагогических работников ВГАВТ позволяет разрабатывать новейшие решения для морского и речного транспорта, не имеющие мировых аналогов.

Нашими постоянными партнерами являются ведущие научные, проектные и производственные предприятия, такие как ОАО «Центральное Конструкторское бюро по судам на подводных крыльях имени Р.Е.Алексеева», ОАО «Конструкторское бюро «Вымпел», Институт прикладной физики РАН.

Среди наших заказчиков ОАО «Газпром», ОАО «Русгидро», ГК «Росатом», ФАУ «Российский речной регистр».

ВГУВТ, продолжая традиции, ведет разработки в области проектирования новейших скоростных судов, машиностроения и машиноремонта, природоохранных технологий. Ведутся перспективные исследования в области проектирования интеллектуальных систем для судоходства.

Многие из наших инновационных разработок выпущены в серийное производство. На базе ВГУВТ организован ряд малых инновационных предприятий, занимающихся внедрением инновационных проектов.

Научный уровень сотрудников подтверждается высокой публикационной активностью в ведущих российских и мировых журналах, изобретательской активностью. Наши молодые ученые и признанные профессора являются лауреатами всероссийских и международных мероприятий и конкурсов. Результаты исследований многих научно педагогических работников регулярно публикуются в выпускаемом Университетом журнале «Вестник ВГАВТ» (индексируется в РИНЦ), публикующем последние научные тенденции в области водного транспорта.

Управлением научных исследований ведется постоянная работа по повышению эффективности научной и инновационной деятельности:

- вводятся новые организационные формы деятельности, такие как Центр коллективного пользования оборудованием (ЦКПО), Учебно-научно-инновационный комплекс «Механик» (УНИК «Механик»);

- уделяется особое внимание молодежной науке: за 2012-15 годы внедрены такие формы организации научной работы студентов, как Студенческое научное общество ВГУВТ (СНО), Научно-образовательный центр «Студенческое конструкторское бюро» (НОЦ СКБ).

Постоянно ведется обновление научно-исследовательской материально-технической базы: организовываются учебно-научные и научные лаборатории, научно-образовательные центры.

Оснащение кафедр соответствует современным требованиям к научно-исследовательскому оборудованию.

 Научная и инновационная работа для Университета была и остается одним из приоритетных направлений деятельности.